Detail práce

Klasifikace DNA sekvence

Bakalářská práce Student: Heczková Petra Akademický rok: 2014/2015 Vedoucí: Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D.
Název anglicky
DNA Sequence Classification
Jazyk práce
český
Abstrakt

Práce se zabývá klasifikací DNA sekvencí. V první části jsou shrnuty informace o existujících metodách a jejich vlastnostech. V druhé části je popsána implementace a experimenty. Průměrná sensitivita metody byla 65% a průmerná specificita 92%.

Klíčová slova

molekulární biologie, DNA, klasifikace, kříľová validace, jazyk R, taxonomicky závislé metody

Ústav
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení B
Obhajoba
15. června 2015
Oponent
Průběh obhajoby

Studentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm B.

Otázky u obhajoby
  1. Jakým způsobem určujete sensitivitu a specificitu implementované metody? V technické zprávě je popsán pouze způsob určení sensitivity a spacificity pro jednotlivé třídy.
  2. Proč byla pro měření podobnosti vektorů použita zrovna Manhattanovská vzdálenost?
Komise
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), předseda
Grézl František, Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Hrubý Martin, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Jaroš Jiří, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Švéda Miroslav, prof. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT), člen
Citace
HECZKOVÁ, Petra. Klasifikace DNA sekvence. Brno, 2015. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2015-06-15. Vedoucí práce Martínek Tomáš. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/16647/
BibTeX
@bachelorsthesis{FITBT16647,
    author = "Petra Heczkov\'{a}",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Klasifikace DNA sekvence",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2015,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/16647/"
}
Nahoru