Detail práce

Zpracování obrazu Petriho misek

Diplomová práce Student: Adámek Jakub Akademický rok: 2014/2015 Vedoucí: Zemčík Pavel, prof. Dr. Ing.
Název anglicky
Processing of Images of Petri Dishes
Jazyk práce
český
Abstrakt

Tato práce se zabývá zpracováním obrazu na Petriho miskách. V první části práce je souhrn odborných výrazů a postupů v laboratorní praxi. Následuje přehled zařízení a algoritmů pro analýzu obrazu Petriho misek. V druhé části je návrh a implementace vlastní aplikace pro automatické počítání bakteriálních kolonií, která byla vyvíjena ve spolupráci s mikrobiologickou laboratoří. Aplikace je určena pro mobilní zařízení s operačním systémem Android. Součástí práce je také návrh a vytvoření dvou osvětlovacích jednotek, které slouží jako příslušenství pro dosažení lepších výsledků při analýze Petriho misky. V závěru práce jsou uvedeny dosažené výsledky, porovnání osvětlovacích jednotek a různých typů mobilních zařízení, na kterých byla aplikace testována.

Klíčová slova

kolonie bakterií, zpracování obrazu, Petriho miska, počítání kolonií, nástroje pro počítání kolonií, agar, mikrobiologie, prahování, watershed, morfologické operace, ColonyCatcher

Ústav
Studijní program
Informační technologie, obor Počítačová grafika a multimédia
Stav
obhájeno, hodnocení A
Obhajoba
22. června 2015
Oponent
Průběh obhajoby

Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A.

Otázky u obhajoby
  1. Jak focení z ruky vyhovuje ergonomii práce laboranta?
  2. Nebylo by vhodné kalibrovat konkrétní zařízení, aby výsledkem byly co nejvíce nevychýlené odhady počtu kolonií?
  3. Jak byste upravoval citlivost (operační bod) automatické detekce? Nebylo by vhodné, aby laborant tuto vlastnost mohl přímo nastavovat?
Komise
Černocký Jan, prof. Dr. Ing. (UPGM FIT VUT), předseda
Herout Adam, prof. Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Hrdina Jaroslav, doc. Mgr., Ph.D. (UM OADM FSI VUT), člen
Křivka Zbyněk, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Smrž Pavel, doc. RNDr., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Strnadel Josef, Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Citace
ADÁMEK, Jakub. Zpracování obrazu Petriho misek. Brno, 2015. Diplomová práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2015-06-22. Vedoucí práce Zemčík Pavel. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/17487/
BibTeX
@mastersthesis{FITMT17487,
    author = "Jakub Ad\'{a}mek",
    type = "Diplomov\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Zpracov\'{a}n\'{i} obrazu Petriho misek",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2015,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/17487/"
}
Nahoru