Detail práce

Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie

Bakalářská práce Student: Radakovič Lukáš Akademický rok: 2014/2015 Vedoucí: Očenášek Pavel, Mgr. Ing., Ph.D.
Název anglicky
Application for the Data Processing in the Area of Evolutionary Biology
Jazyk práce
český
Abstrakt

Tato bakalářská práce se zabývá návrhem a implementací aplikace, která má za úkol ověřit správnost algoritmu sloužícího na analýzu použitých mechanismů při tvorbě fylogenetického stromu. Aplikace umožňuje uživatelům zadat různé parametry fylogenetického stromu, jeho následné vytvoření a analýzu pomocí algoritmu. Výsledky analýzy se uloží do výstupního souboru, přičemž uživatel má možnost nastavit cestu. Zkoumaný algoritmus správně odhaduje podíl mechanismů na tvorbě stromu. Při odhadu relativního a absolutního podílu na změně počtu chromozomů a velikosti genomu nedosahuje přesné výsledky.

Klíčová slova

Fylogenetický strom, aneuploidie, polyploidie, proliferace DNA, odstranění DNA, rozpad chromozomů, spojení chromozomů

Ústav
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení E
Obhajoba
15. června 2015
Oponent
Průběh obhajoby

Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E.

Otázky u obhajoby
  1. Byla již vytvořená aplikace použita biology pro jejich výzkum?
  2. Jakým způsobem byly zvoleny hodnoty parametrů pro testování validátoru (uvedené v tabulce 5.1)? Proč byly vybrány právě tyto hodnoty?
  3. Existují nějaké dostupné nástroje pro simulaci evoluce znaků podél fylogenetických stromů?
Komise
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), předseda
Grézl František, Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Hrubý Martin, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Jaroš Jiří, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Švéda Miroslav, prof. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT), člen
Citace
RADAKOVIČ, Lukáš. Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie. Brno, 2015. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2015-06-15. Vedoucí práce Očenášek Pavel. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/17737/
BibTeX
@bachelorsthesis{FITBT17737,
    author = "Luk\'{a}\v{s} Radakovi\v{c}",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Aplikace pro zpracov\'{a}n\'{i} dat z oblasti evolu\v{c}n\'{i} biologie",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2015,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/17737/"
}
Nahoru