Detail práce
Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem a implementací aplikace, která má za úkol ověřit správnost algoritmu sloužícího na analýzu použitých mechanismů při tvorbě fylogenetického stromu. Aplikace umožňuje uživatelům zadat různé parametry fylogenetického stromu, jeho následné vytvoření a analýzu pomocí algoritmu. Výsledky analýzy se uloží do výstupního souboru, přičemž uživatel má možnost nastavit cestu. Zkoumaný algoritmus správně odhaduje podíl mechanismů na tvorbě stromu. Při odhadu relativního a absolutního podílu na změně počtu chromozomů a velikosti genomu nedosahuje přesné výsledky.
Fylogenetický strom, aneuploidie, polyploidie, proliferace DNA, odstranění DNA, rozpad chromozomů, spojení chromozomů
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E.
- Byla již vytvořená aplikace použita biology pro jejich výzkum?
- Jakým způsobem byly zvoleny hodnoty parametrů pro testování validátoru (uvedené v tabulce 5.1)? Proč byly vybrány právě tyto hodnoty?
- Existují nějaké dostupné nástroje pro simulaci evoluce znaků podél fylogenetických stromů?
Grézl František, Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Hrubý Martin, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Jaroš Jiří, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Švéda Miroslav, prof. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT), člen
@bachelorsthesis{FITBT17737, author = "Luk\'{a}\v{s} Radakovi\v{c}", type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce", title = "Aplikace pro zpracov\'{a}n\'{i} dat z oblasti evolu\v{c}n\'{i} biologie", school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}", year = 2015, location = "Brno, CZ", language = "czech", url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/17737/" }