Detail práce
Interactive Database for the Storage and Maintenance of the Biological Data
Cieľom tejto práce je vytvorenie novej databázy dát pre proteínovú stabilitu, ktorá bude udržiavať a poskytovať experimentálne dáta. Výsledkom práce je databáza FireProtDB, ktorá poskytuje manuálne overené experimentálne dáta z dostupných zdrojov a implementuje grafické užívateľské rozhranie, ktoré poskytuje dôležité informácie o dátach spoločne s možnosťou vyhľadávania umožňujúcim vytvárať dotazy na mieru a cieliacim na užívateľov, ktorí hľadajú dáta pre vytváranie dátových sád pre nástroje využívajúce strojové učenie.
proteínová stabilita, mutácie, databáza, strojové učenie, manuálna kontrola
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných (např. počet návštěvníků vytvořené databáze, podíl na vytvořené vědecké publikaci, ověření současných dat členy týmu a délka validačního procesu). Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A - výborně.
- Proč se databáze zaměřuje pouze na jednobodové mutace resp. vidíte možnost rozšíření vaší práce i o vícebodové mutace?
- Mohou externí uživatelé i přispívat do vytvořené databáze popř. jak plánujete do budoucna udržovat obsah databáze aktuální?
Drábek Vladimír, doc. Ing., CSc. (UPSY FIT VUT), člen
Fučík Otto, doc. Dr. Ing. (UPSY FIT VUT), člen
Křivka Zbyněk, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Smrčka Aleš, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
@mastersthesis{FITMT23790, author = "Ondrej Juraj D\'{u}brava", type = "Diplomov\'{a} pr\'{a}ce", title = "Interactive Database for the Storage and Maintenance of the Biological Data", school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}", year = 2021, location = "Brno, CZ", language = "english", url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/23790/" }