Detail produktu
pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences
Vznik: 2016
Název česky
pqsfinder: R/Bioconductor balíček pro identifikaci sekvencí tvořících kvadruplexy
Typ
software
Licence
podle podmínek - zdarma
Autoři
Hon Jiří, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (FI MUNI)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (FI MUNI)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT)
Klíčová slova
G-kvadruplex; kvadruplex; DNA; R; Bioconductor; rozpoznávání vzorů; vyhledávání; anotace
Popis
Tento balíček poskytuje funkce pro identifikaci sekvencí DNA, které se pravděpodobně skládají do tvaru intramolekulárního G-kvadruplexu. Na rozdíl od konkurenčních řešení je tento balíček schopen detekovat sekvence nedokonalých kvadruplexů obsahující např. neshody nebo výdutě.
Umístění
Licence
Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD (přesné znění licence je dostupné na stránce http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php).
Projekty
Výzkum pokročilých metod ICT a jejich aplikace (FIT-S-14-2299)
Pracoviště