• Výzkumná skupina robotiky Robo@FIT (ROBO)
• Výzkumná skupina výpočetní fotografie - CPhoto@FIT (CPHOTO)

• NES@FIT - Výzkumná skupina počítačové sítě (NES@FIT)
• Výzkumná skupina Hardware-Software Codesign (LISSOM)
• Výzkumná skupina formálních modelů (FM)
• Výzkumná skupina informačních a databázových systémů (IS)
• Výzkumná skupina managementu v softwarovém inženýrství (MSWI)

• Brno University Security Laboratory - FIT (BUSLAB)
• Security Technology Research and Development (STRaDe)
• Výzkumná skupina automatizované analýzy a verifikace - VeriFIT (VERIFIT)
• Výzkumná skupina inteligentních systémů (INTSYS)
• Výzkumná skupina modelování a optimalizace (MODSIM)
• Výzkumná skupina vysoce náročné výpočty (HPC)

• Výzkumná skupina dolování dat z řeči BUT Speech@FIT (SPEECH)
• Výzkumná skupina počítačové grafiky (GRAPH)
• Výzkumná skupina znalostních technologií (KNOT)

• Výzkumná skupina Evolvable Hardware (EHW)
• Výzkumná skupina Nekonvenční číslicové obvody (POLY)
• Výzkumná skupina Spolehlivé systémy (DIAG)
• Výzkumná skupina Superpočítačových technologií SC@FIT (SC@FIT)
• Výzkumná skupina akcelerovaných síťových technologií (ANT)