Detail publikace

Optimizing Biomedical Ultrasound Workflow Scheduling Using Cluster Simulations

JAROŠ Marta, KLUSÁČEK Dalibor a JAROŠ Jiří. Optimizing Biomedical Ultrasound Workflow Scheduling Using Cluster Simulations. In: Job Scheduling Strategies for Parallel Processing. JSSPP 2020. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), roč. 12326. New Orleans: Springer Nature Switzerland AG, 2020, s. 68-84. ISBN 978-3-030-63170-3. Dostupné z: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-030-63171-0_4
Název česky
Optimalizace plánování biomedicínských ultrazvukových řetězců úloh pomocí simulátoru clusterů
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
angličtina
Autoři
Jaroš Marta, Ing., PhD. (UPSY FIT VUT)
Klusáček Dalibor, RNDr., Ph.D. (CESNET)
Jaroš Jiří, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT)
URL
Klíčová slova

plánování, řetězec úloh, k-Dispatch, simulace, ALEA

Abstrakt

Terapeutický ultravuk hraje významnou roli v boji s onkologickými nemocemi, cílené aplikaci léků a neurostimulaci. Ke zlepšení léčebných procedur je nutné provést předoperační plánování pomocí komplexních numerických modelů, které uvažují anatomii konkrétního pacienta. Z výpočetního hlediska je na plánování léčby pohlíženo jako na řetězec úloh, které sestává s několika úloh s různými výpočetními nároky, a který je spuštěn na vzdáleném clusteru či cloudu. Jelikož jsou tyto zdroje drahé, plánování řetězců úloh hraje významnou roli v celém procesu léčby. Tato publikace popisuje rozšířenou verzi aplikace k-Dispatch, systému pro správu řetězců úloh, která využívá v minulosti nasbíraných výkonnostních metrik spouštěných úloh k výběru vhodného počtu výpočetních zdrojů a odhadu celkového výpočetního času a ceny. Tato publikace rovněž představuje nutné zásahy to simulátoru clusterů ALEA, aby bylo umožněno simulovat odhad času straveného ve výpočetních frontách a odhad výpočetního času pro celý řetězec úloh. Spojení systému k-Dispatch a ALEA umožňuje detailní optimalizaci spouštěcích parametrů pro řetězce úloh s ohledem na aktuální vytížení clusteru. Experimentální výsledky ukazjí, že pomocí tohoto přístupu jsme schopni redukovat výpočetní čas o 26 %.

Rok
2020
Strany
68-84
Sborník
Job Scheduling Strategies for Parallel Processing. JSSPP 2020
Řada
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
Svazek
12326
Konference
Job Scheduling Strategies for Parallel Processing 23rd International Workshop, JSSPP 2020, New Orleans, LA, USA, May 22, US
ISBN
978-3-030-63170-3
Vydavatel
Springer Nature Switzerland AG
Místo
New Orleans, US
DOI
10.1007/978-3-030-63171-0_4
EID Scopus
2-s2.0-85097306932
BibTeX 
@INPROCEEDINGS{FITPUB12299,
   author = "Marta Jaro\v{s} and Dalibor Klus\'{a}\v{c}ek and Ji\v{r}\'{i} Jaro\v{s}",
   title = "Optimizing Biomedical Ultrasound Workflow Scheduling Using Cluster Simulations",
   pages = "68--84",
   booktitle = "Job Scheduling Strategies for Parallel Processing. JSSPP 2020",
   series = "Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)",
   volume = 12326,
   year = 2020,
   location = "New Orleans, US",
   publisher = "Springer Nature Switzerland AG",
   ISBN = "978-3-030-63170-3",
   doi = "10.1007/978-3-030-63171-0\_4",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/12299"
}
Nahoru