Detail publikace

Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases

ZÁMOCKÝ Marcel, MUSIL Miloš, BANCHENKO Maksym, FERIANC Peter, CHOVANOVÁ Katarína, BARÁTH Peter, POLJOVKA Andrej a BEDNÁŘ David. Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases. Biology, roč. 11, č. 3, 2022, s. 1-18. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://www.mdpi.com/2079-7737/11/3/459
Název česky
Náhled do specifického vývoje houbových hybridních B hemperoxidáz
Typ
článek v časopise
Jazyk
angličtina
Autoři
Zámocký Marcel (SAV)
Musil Miloš, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT)
Banchenko Maksym (SAV)
Ferianc Peter (SAV)
Chovanová Katarína (SAV)
Baráth Peter (SAV)
Poljovka Andrej (SAV)
Bednář David, Mgr. (LL)
URL
Klíčová slova

hybrid B hemperoxidáza, superrodina peroxidázakataláza, oxidační stres, enzymatický antioxidant, ancestrální rekonstrukce

Abstrakt

V této studii se zaměřujeme na podrobnou bioinformatickou analýzu genů hyBpox, zejména v genomech Sclerotiniaceae (Ascomycota, Leotiomycetes), což je specificky vyvinutá rodina hub nekrotrofních hostitelských generalistů a specialistů na saprofytické nebo biotrofní hostitele. Zástupci rodu Sclerotium produkují pouze sklerocia a žádné plodnice nebo výtrusy. Jejich fyziologická úloha pro peroxidázy tedy zůstává otevřená. Reprezentativní druh, S. cepivorum, je nebezpečný rostlinný patogen způsobující bílou hnilobu u druhů Allium, zejména u cibule, pórku a česneku. V celosvětovém měřítku je bílá hniloba způsobená touto půdní houbou zřejmě nejvážnější hrozbou pro produkci Allium. Také jsme našli velmi podobné sekvence peroxidázy v příbuzné houbě S. sclerotiorum, i když s malými, ale důležitými modifikacemi v architektuře jejího aktivního centra. Přítomnost mRNA specifické pro ScephyBpox1 byla potvrzena transkriptomickou analýzou. Přítomnost Hybrid B peroxidázy na úrovni proteinu jako jediné extracelulární peroxidázy této houby byla potvrzena v sekretomu S. cepivorum pomocí podrobných proteomických analýz. To nás přimělo systematicky hledat všechny dostupné geny kódující Hybridní B hem peroxidázy v celé houbové rodině Sclerotiniaceae. Uvádíme zde rekonstrukci jejich molekulární fylogeneze a analyzujeme jedinečné aspekty jejich rysů konzervovaných sekvencí a strukturních záhybů v odpovídajících sekvencích předků.

Rok
2022
Strany
1-18
Časopis
Biology, roč. 11, č. 3, ISSN 2079-7737
Vydavatel
MDPI
DOI
10.3390/biology11030459
UT WoS
000776175200001
EID Scopus
2-s2.0-85127589607
BibTeX 
@ARTICLE{FITPUB12724,
   author = "Marcel Z\'{a}mock\'{y} and Milo\v{s} Musil and Maksym Banchenko and Peter Ferianc and Katar\'{i}na Chovanov\'{a} and Peter Bar\'{a}th and Andrej Poljovka and David Bedn\'{a}\v{r}",
   title = "Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases",
   pages = "1--18",
   journal = "Biology",
   volume = 11,
   number = 3,
   year = 2022,
   ISSN = "2079-7737",
   doi = "10.3390/biology11030459",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/12724"
}
Nahoru