Detail publikace

Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression

ZWINSOVÁ Barbora, PETROV Viacheslav, HRIVŇÁKOVÁ Martina, SMATANA Stanislav, MICENKOVÁ Lenka, KAZDOVÁ Natálie, POPOVICI Vlad, HRSTKA Roman, ŠEFR Roman, BENCSIKOVÁ Beatric, ZDRAŽILOVÁ-DUBSKÁ Lenka, BRYCHTOVÁ Veronika, NENUTIL Rudolf, VÍDEŇSKÁ Petra a BUDINSKÁ Eva. Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression. Cancers, roč. 13, č. 19, 2021, s. 1-25. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8507728/
Název česky
Mikrobiom sliznice kolorektálního nádoru je obohacen o orální patogeny a definuje tři podtypy, které korelují s markery progrese nádoru
Typ
článek v časopise
Jazyk
angličtina
Autoři
Zwinsová Barbora, Mgr. (PřF MUNI)
Petrov Viacheslav, Ph.D. (PřF MUNI)
Hrivňáková Martina, Mgr. (PřF MUNI)
Smatana Stanislav, Ing. (UPSY FIT VUT)
Micenková Lenka, Mgr., Ph.D. (PřF MUNI)
Kazdová Natálie, Bc. (PřF MUNI)
Popovici Vlad, doc. Ing., Ph.D. (PřF MUNI)
Hrstka Roman, doc. Mgr., Ph.D. (MOU)
Šefr Roman, doc. MUDr., Ph.D. (MOU)
Bencsiková Beatric, MUDr., Ph.D. (MOU)
Zdražilová-Dubská Lenka, doc. RNDr., Ph.D. (MOU)
Brychtová Veronika, Mgr., Ph.D. (MOU)
Nenutil Rudolf, MUDr., CSc. (MOU)
Vídeňská Petra, Mgr., Ph.D. (MOU)
Budinská Eva, Mgr., Ph.D. (PřF MUNI)
URL
Klíčová slova

Gen 16S rRNA, Kolorektální karcinom, Mikrobiální podtypy, Nádorový mikrobiom

Abstrakt

Dlouhodobá dysbióza střevního mikrobiomu má významný vliv na progresi kolorektálního karcinomu (CRC) a vysvětluje část pozorované heterogenity onemocnění. I když byly popsány posuny ve střevním mikrobiomu v sekvenci normálního adenomu a karcinomu, krajina mikrobiomu v rámci CRC a její asociace s klinickými proměnnými zůstávají nedostatečně prozkoumány. Provedli jsme sekvenování genu 16S rRNA párové nádorové tkáně, přilehlé vizuálně normální sliznice a výtěrů stolice 178 pacientů s CRC stadia 0IV, abychom popsali mikrobiom nádoru a jeho asociaci s klinickými proměnnými. Identifikovali jsme nové rody asociované buď s nádorovou sliznicí CRC nebo CRC obecně. V nádorové sliznici dominovaly rody patřící k orálním patogenům. Na základě nádorového mikrobiomu jsme rozvrstvili pacienty s CRC do tří podtypů, které byly významně spojeny s prognostickými faktory, jako je grade nádoru, stranovost a staging TNM, mutace BRAF a stav MSI. Zjistili jsme, že mikrobiom CRC silně koreluje se stupněm, umístěním a stádiem, ale tyto asociace jsou závislé na mikrobiálním prostředí. Naše studie otevírá nové možnosti výzkumu v detekci progrese onemocnění biomarkerem mikrobiomu CRC a zároveň identifikuje jeho omezení, což naznačuje potřebu kombinace několika míst odběru vzorků (např. stolice a výtěry z nádorů).

Rok
2021
Strany
1-25
Časopis
Cancers, roč. 13, č. 19, ISSN 2072-6694
Vydavatel
MDPI
DOI
10.3390/cancers13194799
UT WoS
000773923000016
EID Scopus
2-s2.0-85115786809
BibTeX 
@ARTICLE{FITPUB12942,
   author = "Barbora Zwinsov\'{a} and Viacheslav Petrov and Martina Hriv\v{n}\'{a}kov\'{a} and Stanislav Smatana and Lenka Micenkov\'{a} and Nat\'{a}lie Kazdov\'{a} and Vlad Popovici and Roman Hrstka and Roman \v{S}efr and Beatric Bencsikov\'{a} and Lenka Zdra\v{z}ilov\'{a}-Dubsk\'{a} and Veronika Brychtov\'{a} and Rudolf Nenutil and Petra V\'{i}de\v{n}sk\'{a} and Eva Budinsk\'{a}",
   title = "Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression",
   pages = "1--25",
   journal = "Cancers",
   volume = 13,
   number = 19,
   year = 2021,
   ISSN = "2072-6694",
   doi = "10.3390/cancers13194799",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/12942"
}
Nahoru