Detail publikace
Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression
Petrov Viacheslav, Ph.D. (PřF MUNI)
Hrivňáková Martina, Mgr. (PřF MUNI)
Smatana Stanislav, Ing. (UPSY FIT VUT)
Micenková Lenka, Mgr., Ph.D. (PřF MUNI)
Kazdová Natálie, Bc. (PřF MUNI)
Popovici Vlad, doc. Ing., Ph.D. (PřF MUNI)
Hrstka Roman, doc. Mgr., Ph.D. (MOU)
Šefr Roman, doc. MUDr., Ph.D. (MOU)
Bencsiková Beatric, MUDr., Ph.D. (MOU)
Zdražilová-Dubská Lenka, doc. RNDr., Ph.D. (MOU)
Brychtová Veronika, Mgr., Ph.D. (MOU)
Nenutil Rudolf, MUDr., CSc. (MOU)
Vídeňská Petra, Mgr., Ph.D. (MOU)
Budinská Eva, Mgr., Ph.D. (PřF MUNI)
Gen 16S rRNA, Kolorektální karcinom, Mikrobiální podtypy, Nádorový mikrobiom
Dlouhodobá dysbióza střevního mikrobiomu má významný vliv na progresi kolorektálního karcinomu (CRC) a vysvětluje část pozorované heterogenity onemocnění. I když byly popsány posuny ve střevním mikrobiomu v sekvenci normálního adenomu a karcinomu, krajina mikrobiomu v rámci CRC a její asociace s klinickými proměnnými zůstávají nedostatečně prozkoumány. Provedli jsme sekvenování genu 16S rRNA párové nádorové tkáně, přilehlé vizuálně normální sliznice a výtěrů stolice 178 pacientů s CRC stadia 0IV, abychom popsali mikrobiom nádoru a jeho asociaci s klinickými proměnnými. Identifikovali jsme nové rody asociované buď s nádorovou sliznicí CRC nebo CRC obecně. V nádorové sliznici dominovaly rody patřící k orálním patogenům. Na základě nádorového mikrobiomu jsme rozvrstvili pacienty s CRC do tří podtypů, které byly významně spojeny s prognostickými faktory, jako je grade nádoru, stranovost a staging TNM, mutace BRAF a stav MSI. Zjistili jsme, že mikrobiom CRC silně koreluje se stupněm, umístěním a stádiem, ale tyto asociace jsou závislé na mikrobiálním prostředí. Naše studie otevírá nové možnosti výzkumu v detekci progrese onemocnění biomarkerem mikrobiomu CRC a zároveň identifikuje jeho omezení, což naznačuje potřebu kombinace několika míst odběru vzorků (např. stolice a výtěry z nádorů).
@ARTICLE{FITPUB12942, author = "Barbora Zwinsov\'{a} and Viacheslav Petrov and Martina Hriv\v{n}\'{a}kov\'{a} and Stanislav Smatana and Lenka Micenkov\'{a} and Nat\'{a}lie Kazdov\'{a} and Vlad Popovici and Roman Hrstka and Roman \v{S}efr and Beatric Bencsikov\'{a} and Lenka Zdra\v{z}ilov\'{a}-Dubsk\'{a} and Veronika Brychtov\'{a} and Rudolf Nenutil and Petra V\'{i}de\v{n}sk\'{a} and Eva Budinsk\'{a}", title = "Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression", pages = "1--25", journal = "Cancers", volume = 13, number = 19, year = 2021, ISSN = "2072-6694", doi = "10.3390/cancers13194799", language = "english", url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/12942" }