Detail předmětu
Strukturní biologie
Garant předmětu
Jazyk výuky
Zakončení
Rozsah
- 26 hod. přednášky
- 26 hod. cvičení
Bodové hodnocení
- 100 bodů závěrečná zkouška
Zajišťuje ústav
Získané dovednosti, znalosti a kompetence z předmětu
Předmět nemá znalosti.
Cíle předmětu
Po úspěšném ukončení tohoto kurzu budou studenti schopni:
- popsat strukturu biomolekul a jak se experimentálně určují
- získat struktury biomolekul z vhodných databází
- identifikovat možné chyby ve struktuře proteinů
- predikovat struktury biomolekul a jejich komplexů
- analyzovat struktury proteinů za účelem získání informací o jejich funkci, dynamice či stabilitě
- posoudit efekt mutace na funkci proteinů
Požadované prerekvizitní znalosti a dovednosti
Nejsou žádné prerekvizity.
Osnova přednášek
- Struktura biologických makromolekul - složení, metody stanovení, využití v biologii, vizualizace.
- Databáze experimentálních struktur - získání a hodnocení struktur makromolekul, vybrané strukturní databáze.
- Modely struktur - databáze modelů, metody hodnoceni kvality modelů, příprava modelů.
- Stabilita a dynamika makromolekul - analýza stability a dynamiky a jejich databáze.
- Analýza struktury proteinu - identifikace důležitých regionů: vazebná/aktivní místa, transportní cesty, flexibilní regiony, katalytické aminokyseliny.
- Predikce struktury makromolekulárních komplexů.
- Komplexy protein-protein - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
- Komplexy protein-DNA - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
- Komplexy protein-ligand - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
- Modifikace struktury proteinu - stanovení vlivu mutace na strukturu a funkci proteinu.
- Aplikace strukturní biologie - biologický výzkum, hledání nových léčiv, design biokatalyzátorů.
Průběžná kontrola studia
Hodnocení studia je založeno na bodovacím systému. Pro úspěšné absolvování předmětu je nutno dosáhnout 50 bodů.
Kontrolovaná výuka
Výuka není kontrolována.