Detail práce

Rekonstrukce transposonů

Bakalářská práce Student: Šurina Oliver Akademický rok: 2015/2016 Vedoucí: Puterová Janka, Ing., Ph.D.
Název anglicky
Reconstruction of Transposons
Jazyk práce
český
Abstrakt

Táto práca sa zaoberá rekonštrukciou transpozónov na základe výstupu programu RepeatExplorer. V prvej časti práca predstavuje základy molekulárnej biológie so zameraním na transpozóny a ich štruktúru. Ďalej popisuje návrh a implementáciu aplikácie, ktorá rekonštruuje transpozóny na základe výstupov RepeatExploreru. K prezentácii dosiahnutých výsledkov bolo vytvorené interaktívne grafické uživateľské rozhranie. Aplikácia bola ná- sledne testovaná v realnom prostredí. Práca tiež prináša prehľad o existujúcich nástrojoch pre identifikáciu transpozónov.

Klíčová slova

DNA, transpozóny, LTR, RepeatExplorer, rekonstrukce transpozónov, GUI

Ústav
Ústav informačních systémů FIT VUT v Brně
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení E
Obhajoba
15. června 2016
Oponent
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D.
Průběh obhajoby

Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E.

Otázky u obhajoby
  1. Ve své práci ověřujete primárně dva modely LTR transpozonů (Copia, Gypsy). Lze do vašeho nástroje zakomponovat i další modely? Pokud ano, co všechno je potřeba nastavit/změnit?
Komise
Meduna Alexander, prof. RNDr., CSc. (UIFS FIT VUT), předseda
Burget Lukáš, doc. Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Holík Lukáš, doc. Mgr., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Jaroš Jiří, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Křivka Zbyněk, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Citace
ŠURINA, Oliver. Rekonstrukce transposonů. Brno, 2016. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2016-06-15. Vedoucí práce Puterová Janka. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/18960/
BibTeX 
@bachelorsthesis{FITBT18960,
    author = "Oliver \v{S}urina",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Rekonstrukce transposon\r{u}",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2016,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/18960/"
}

Závěrečné práce

Nahoru