Detail práce

Hledání vhodných deskriptorů pro popis bakteriálních genomů

Bakalářská práce Student: Vanek Roman Akademický rok: 2016/2017 Vedoucí: Burgetová Ivana, Ing., Ph.D.
Název anglicky
Search of the Bacterial Genome Descriptor
Jazyk práce
český
Abstrakt

Táto bakalárska práca sa zaoberá skúmaním DNA sekvencií genómov rôznych baktérií. Cieľom je určiť, či je možné na základe počtov n-tíc nukleotidov zistiť, z ktorej baktérie, resp. druhu baktérií sekvencia pochádza. Výsledky skúmania boli získané pomocou nástroja, ktorého realizácia tvorí súčasť práce. Výstupom tejto práce sú experimenty so sekvenciami na báze štatistických výpočtov s frekvenciami n-tíc a rozhodnutie, či je tento prístup prínosný.

Klíčová slova

bakteriálny genóm, biologická databáza, nukleotid, fylogenetický strom

Ústav
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení C
Obhajoba
14. června 2017
Oponent
Průběh obhajoby

Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C.

Otázky u obhajoby
  1. Máte představu, jak hodnocení přesnosti vašeho klasifikátoru ovlivňuje konkrétní výběr 13-ti sekvencí bakteriálních genomů? Napadá vás, jak fázi testování učinit více nezávislou?
Komise
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), předseda
Dytrych Jaroslav, Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Hrubý Martin, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Kořenek Jan, doc. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Švéda Miroslav, prof. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT), člen
Citace
VANEK, Roman. Hledání vhodných deskriptorů pro popis bakteriálních genomů. Brno, 2017. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2017-06-14. Vedoucí práce Burgetová Ivana. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/19659/
BibTeX
@bachelorsthesis{FITBT19659,
    author = "Roman Vanek",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Hled\'{a}n\'{i} vhodn\'{y}ch deskriptor\r{u} pro popis bakteri\'{a}ln\'{i}ch genom\r{u}",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2017,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/19659/"
}
Nahoru