Detail práce

Interpretace dat z biočipů

Bakalářská práce Student: Ludwig Petr Akademický rok: 2007/2008 Vedoucí: Smrž Pavel, doc. RNDr., Ph.D.
Název anglicky
Microarray Data Interpretation
Jazyk práce
český
Abstrakt

Tato práce se zabývá interpretací dat získaných pomocí technologie biočipů. Práce obsahuje také krátký úvod do problematiky genetické informace a jejího významu. Jádrem práce je pak sada skriptů provádějící analýzy nad testovacími daty. Jako vstupní data jsou použity výstupy biočipové analýzy tkání s rakovinou tlustého střeva. Dílčí výsledek je určení genových markerů rakoviny tlustého střeva. Finální výsledek určuje postavení markerů v kontextu objevených signálních drah, ty jsou nakonec seřazeny dle relevance.

Klíčová slova

biočip, genové signální dráhy, genová ontologie, Desmin, bioinformatika, genetika, geny, exprese genů, down regulace, up regulace, KEGG, BioRuby, Ruby, rakovina, karcinom, tumor, tlusté střevo, DNA, RNA, nukleové kyseliny

Ústav
Ústav počítačové grafiky a multimédií FIT VUT v Brně
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení C
Obhajoba
12. června 2008
Oponent
Šilhavá Jana, Ing.
Komise
Černocký Jan, prof. Dr. Ing. (UPGM FIT VUT), předseda
Herout Adam, prof. Ing., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Lukáš Roman, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Ráček Jaroslav, RNDr., Ph.D. (FI MUNI), člen
Vojnar Tomáš, prof. Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Zbořil František, doc. Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Citace
LUDWIG, Petr. Interpretace dat z biočipů. Brno, 2008. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2008-06-12. Vedoucí práce Smrž Pavel. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/7027/
BibTeX 
@bachelorsthesis{FITBT7027,
    author = "Petr Ludwig",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Interpretace dat z bio\v{c}ip\r{u}",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2008,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/7027/"
}

Závěrečné práce

Nahoru