Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

Zkratka: MBI

Délka studia: 2 roky

Počet kreditů: 120

Program: Informační technologie

Jazyk výuky: česky

Forma studia: prezenční

Akreditace od: Akreditace do: 2015 Ukončení přijímání: 2019

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se obvody, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Garant

Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D.

Rozsah státních závěrečných zkoušek

Státní závěrečná zkouška (SZZ) má dvě části, a to obhajobu diplomové práce a ústní část v podobě odborné rozpravy o zadaných tématických okruzích z předmětu "Bioinformatika a biocomputing", jehož náplň vychází z vybraných povinných předmětů na oboru MBI, kterými jsou Bioinformatika, Biologií inspirované počítače, Teorie her, Pokročilá bioinformatika, Získávání znalostí z databází, Biometrické systémy, Soft Computing, Matematické struktury v informatice, Teoretická informatika, Hardware/Software codesign, Molekulární genetika, Pokročilé databázové systémy a Paralelní a distribuované algoritmy. Rada studijního oboru schválí výběr tématických okruhů. Studenti jsou o těchto tématických okruzích informování nejméně 2 měsíce před SZZ v daném akademickém roce.

Příklady témat závěrečných prací

Diplomové práce jsou uloženy v Knihovně FIT, Božetěchova 2, Brno. Seznam diplomových prací včetně detailů je dostupný na Webu FIT:
https://www.fit.vut.cz/study/theses/.cs

Výběr akademického roku a studijního plánu

1. ročník, zimní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
BIO	Biometrické systémy	5	P	ZaZk	FIT
HSC	Hardware/Software Codesign	5	P	Zk	FIT
MAT	Matematické struktury v informatice	5	P	Zk	FIT
MOG	Molekulární genetika	3	P	Zk	FIT
PDB	Pokročilé databázové systémy	5	P	ZaZk	FIT
TIN	Teoretická informatika	5	P	ZaZk	FIT
BIS	Bezpečnost informačních systémů	5	PV	Zk	FIT
SIN	Inteligentní systémy	5	PV	Zk	FIT
STI	Seminář teoretické informatiky	2	V	Za	FIT

1. ročník, letní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
BIF	Bioinformatika	5	P	Zk	FIT
BIN	Biologií inspirované počítače	5	P	Zk	FIT
PRL	Paralelní a distribuované algoritmy	5	P	ZaZk	FIT
AGS	Agentní a multiagentní systémy	5	PV	Zk	FIT
EVO	Aplikované evoluční algoritmy	5	PV	Zk	FIT
KKO	Kódování a komprese dat	5	PV	ZaZk	FIT
KRY	Kryptografie	5	PV	ZaZk	FIT
NSB	Návrh, správa a bezpečnost	5	PV	ZaZk	FIT
POS	Pokročilé operační systémy	5	PV	Zk	FIT
SNT	Simulační nástroje a techniky	5	PV	ZaZk	FIT
ZRE	Zpracování řečových signálů	5	PV	Zk	FIT

2. ročník, zimní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
PBI	Pokročilá bioinformatika	4	P	Zk	FIT
SEP	Semestrální projekt	3	P	Klz	FIT
SFC	Soft Computing	5	P	Zk	FIT
THE	Teorie her	4	P	ZaZk	FIT
ZZN	Získávání znalostí z databází	5	P	ZaZk	FIT
PCS	Pokročilé číslicové systémy	5	PV	Zk	FIT

2. ročník, letní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
DIP	Diplomový projekt	10	P	Za	FIT
MSZ	Státní závěrečná zkouška ^*)	0	P	Zk	FIT
ARC	Architektura a programování paralelních systémů	5	PV	ZaZk	FIT
NAV	Návrh externích adaptérů a vestavěných systémů	5	PV	Zk	FIT
PDS	Přenos dat, počítačové sítě a protokoly	5	PV	Zk	FIT

libovolný ročník, zimní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
AEC	Efektivní čtení odborných anglických textů	3	PV	ZaZk	FIT
AEU	Angličtina pro Evropu	3	PV	ZaZk	FIT
AJE	Akademické jazykové dovednosti se zaměřením na elektroinženýrství a informatiku	3	PV	ZaZk	FIT
ASA	Angličtina pro Severní Ameriku	3	PV	ZaZk	FIT
FIT	Dějiny a filozofie techniky	3	PV	Za	FIT
PRM	Právní minimum	3	PV	Za	FIT
RET	Rétorika	3	PV	Za	FIT
ACH	Architektura procesorů	5	V	ZaZk	FIT
AIS	Analýza a návrh informačních systémů	5	V	ZaZk	FIT
BMS	Bezdrátové a mobilní sítě	5	V	Zk	FIT
CP2	Zabezpečení sítí WAN (CCNP2)	4	V	Klz	FIT
EIP	Ekonomie informačních produktů	5	V	Zk	FIT
FAV	Formální analýza a verifikace	5	V	ZaZk	FIT
GAL	Grafové algoritmy	5	V	Zk	FIT
GMU	Grafické a multimediální procesory	5	V	ZaZk	FIT
GUX	Grafická uživatelská rozhraní v X Window	5	V	Zk	FIT
GZN	Grafická a zvuková rozhraní a normy	5	V	Zk	FIT
KRG	Kreativní grafika	4	V	Klz	FIT
OPM	Optimalizace	4	V	ZaZk	FIT
PDI	Prostředí distribuovaných aplikací	5	V	Zk	FIT
PGP	Pokročilá počítačová grafika	5	V	Zk	FIT
PGR	Počítačová grafika	5	V	Zk	FIT
PKS	Pokročilé komunikační systémy	5	V	ZaZk	FIT
POV	Počítačové vidění	5	V	Zk	FIT
ROB	Robotika	5	V	Zk	FIT
ROS	Real-time operační systémy	5	V	Zk	FIT
SEN	Inteligentní senzory	5	V	ZaZk	FIT
SRE	Systémy zpracování řeči	5	V	Zk	FIT
SRI	Strategické řízení informačních systémů	5	V	ZaZk	FIT
TAM	Tvorba aplikací pro mobilní zařízení	5	V	Zk	FIT
ZPX	Zahraniční odborná praxe	5	V	Za	FIT

libovolný ročník, letní semestr
Zkr	Název	Kr	Pov	Zak	Fa
AEC	Efektivní čtení odborných anglických textů	3	PV	ZaZk	FIT
AEU	Angličtina pro Evropu	3	PV	ZaZk	FIT
AJE	Akademické jazykové dovednosti se zaměřením na elektroinženýrství a informatiku	3	PV	ZaZk	FIT
ASA	Angličtina pro Severní Ameriku	3	PV	ZaZk	FIT
FIK	Filozofie a kultura	3	PV	Za	FIT
PRM	Právní minimum	3	PV	Za	FIT
RET	Rétorika	3	PV	Za	FIT
CP4	Optimalizované a konvergentní sítě (CCNP4)	4	V	Klz	FIT
DJA	Dynamické jazyky	5	V	Zk	FIT
FLP	Funkcionální a logické programování	5	V	ZaZk	FIT
FSY	Fuzzy systémy pro řízení a modelování	5	V	ZaZk	FIT
FYO	Fyzikální optika	5	V	Zk	FIT
GIS	Geografické informační systémy	5	V	ZaZk	FIT
GJA	Grafická uživatelská rozhraní v Javě	5	V	Zk	FIT
LOG	Logika	5	V	ZaZk	FIT
MAR	Marketing	5	V	ZaZk	FIT
MEK	Manažerská ekonomika	5	V	ZaZk	FIT
MOB	Modelování biologických systémů	5	V	ZaZk	FIT
MPR	Management projektů	5	V	Zk	FIT
MUL	Multimédia	5	V	Zk	FIT
PES	Petriho sítě	5	V	Zk	FIT
PIS	Pokročilé informační systémy	5	V	ZaZk	FIT
SLO	Složitost	5	V	Zk	FIT
SPP	Systémy odolné proti poruchám	5	V	ZaZk	FIT
SSP	Stochastické procesy	4	V	ZaZk	FIT
STM	Strategický management	5	V	ZaZk	FIT
VIN	Výtvarná informatika	5	V	Zk	FIT
VIZ	Vizualizace a CAD	5	V	Zk	FIT
VNV	Vysoce náročné výpočty	5	V	Zk	FIT
WAP	Internetové aplikace	5	V	ZaZk	FIT
ZPO	Zpracování obrazu	5	V	Zk	FIT
ZPX	Zahraniční odborná praxe	5	V	Za	FIT

Předmět není v tomto akademickém roce otevřen

Zak: Způsob zakončení předmětu: Zk - zkouška, Za - zápočet, Klz - klas. zápočet, Kol - Kolokvium
Pov: P - povinný, PV - povinně volitelný, D - doporučený, V - volitelný

Studijní program

Bioinformatika a biocomputing

Výběr akademického roku a studijního plánu

1. ročník, zimní semestr

1. ročník, letní semestr

2. ročník, zimní semestr

2. ročník, letní semestr

libovolný ročník, zimní semestr

libovolný ročník, letní semestr