Detail práce
Techniky klasifikace proteinů
Hlavným cieľom klasifikácie proteínov do rodín je pochopiť štruktúrne, funkčné a evolučné vzťahy medzi jednotlivými proteínmi, ktoré nie sú jednoducho odvoditeľné z dostupných dát. Keďže štruktúra a funkcia proteínov spolu úzko súvisia, zisťovanie funkcie vychádza hlavne zo štruktúrnych vlastností, ktoré sa dajú so súčasnými prostriedkami získať pomerne jednoducho. Klasifikácia proteínov má svoje miesto taktiež pri vývoji špeciálnych liekov, diagnostikovaní klinických chorôb alebo v personalizovanej zdravotnej starostlivosti, vďaka čomu sa do nej investuje značné množstvo zdrojov. V práci som vytvoril nový hierarchický nástroj pre klasifikáciu proteínov, ktorý dosahuje lepšie výsledky ako niektoré existujúce riešenia. Realizácii nástroja predchádzalo oboznámenie s vlastnosťami proteínov, preskúmanie existujúcich prístupov klasifikácie, tvorba rozsiahlej dátovej sady, uskutočnenie experimentov a výber výsledných klasifikátorov hierarchického nástroja.
proteín, aminokyselina, klasifikácia, neurónová sieť, SVM, náhodný les, vektor príznakov
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A.
- V závěru uvádíte jako jedno z možných pokračování práce kombinaci několika metod extrakce příznaků. Jak by taková kombinace mohla vypadat?
- Má nějaký přínos kombinace metod?
Lengál Ondřej, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Orság Filip, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Rogalewicz Adam, doc. Mgr., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Veselý Vladimír, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
@mastersthesis{FITMT21685,
author = "Luk\'{a}\v{s} Dekr\'{e}t",
type = "Diplomov\'{a} pr\'{a}ce",
title = "Techniky klasifikace protein\r{u}",
school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
year = 2020,
location = "Brno, CZ",
language = "slovak",
url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/21685/"
}