Detail práce

Vizualizace značených buněk modelového organismu

Diplomová práce Student: Kubíček Radek Akademický rok: 2006/2007 Vedoucí: Herout Adam, prof. Ing., Ph.D.
Název anglicky
Visualization of Marked Cells of a Model Organism
Jazyk práce
český
Abstrakt

Tato diplomová práce, zabývající se zobrazením volumetrických (objemových) dat, má za úkol zobrazit a zvýraznit značené buňky modelových organismů v datech sejmutých konfokálním mikroskopem. Vstupní data tvoří jednolitý volumetrický celek složený z jednotlivých řezů, který je nutno vhodnou metodou zobrazit a poté identifikovat a zvýraznit buňky označené metodou GFP (Green Fluorescent Protein) nebo fluoreskováním chlorofylu.

Hlavním cílem této práce je nalézt pokud možno optimální efektivní metodu umožňující toto zvýraznění, pracující ideálně bez manuálního zásahu uživatele. Vzhledem ke struktuře dat je však tento cíl jen těžko splnitelný, proto postačí nalezení metody operující v manuálním režimu. Nakonec je třeba dosažené výsledky práce zaintegrovat do nástroje FluorCam pro zobrazování dat z dekonvolučního konfokálního mikroskopu.

Klíčová slova

volumetrická data, objemová data, zobrazení volumetrických dat, zobrazení objemových dat, volumetrické zobrazení, 3D textury, zobrazení biologických dat, Caenorhabditis elegans, GFP, Green Fluorescent Protein, FluorCam, GPU akcelerace, shader

Ústav
Ústav počítačové grafiky a multimédií FIT VUT v Brně
Studijní program
Informační technologie, obor Počítačová grafika a multimédia
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení A
Obhajoba
21. června 2007
Oponent
Kršek Přemysl, doc. Ing., Ph.D.
Komise
Zemčík Pavel, prof. Dr. Ing. (UPGM FIT VUT), předseda
Fučík Otto, doc. Dr. Ing. (UPSY FIT VUT), člen
Křena Bohuslav, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Racek Stanislav, doc. Ing., CSc. (ZČU v Plzni), člen
Smrž Pavel, doc. RNDr., Ph.D. (UPGM FIT VUT), člen
Vojnar Tomáš, prof. Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Citace
KUBÍČEK, Radek. Vizualizace značených buněk modelového organismu. Brno, 2007. Diplomová práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2007-06-21. Vedoucí práce Herout Adam. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/2672/
BibTeX 
@mastersthesis{FITMT2672,
    author = "Radek Kub\'{i}\v{c}ek",
    type = "Diplomov\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Vizualizace zna\v{c}en\'{y}ch bun\v{e}k modelov\'{e}ho organismu",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2007,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/2672/"
}

Závěrečné práce

Nahoru