Detail práce
Analýza genomických dat s využitím algoritmu BLAST
Tato bakalářská práce se zabývá analýzou genomických dat s využitím algoritmu BLAST. V teoretické části popisuje genetické informace, jejich význam a strukturu. Dále zde naleznete popis algoritmu BLAST, Smith-Waterman a Needleman-Wunsch a s algoritmem BLAST spojenou Karlin-Altschul statistiku. Tato práce také pojednává o typech databází jako prostorové, deduktivní a relační, které ukládají genomické informace. Druhá část se zabývá návrhem a implementací aplikace, která využívá zmíněné algoritmy a databázi Oracle 10g R2. Součástí práce je i testování či srovnání výstupů algoritmů.
Genetika, DNA, protein, BLAST, Smith-Waterman, Needleman-Wunsch, substituční matice BLOSUM, PAM, teorie Margaret Dayhoff, Karlin-Altschul statistiky, Oracle 10g
Křena Bohuslav, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Lukáš Roman, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Motyčka Arnošt, doc. Ing., CSc. (Mendelu), člen
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Zbořil František, doc. Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
@bachelorsthesis{FITBT6644, author = "Martina K\v{r}\'{i}\v{z}ov\'{a}", type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce", title = "Anal\'{y}za genomick\'{y}ch dat s vyu\v{z}it\'{i}m algoritmu BLAST", school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}", year = 2008, location = "Brno, CZ", language = "czech", url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/6644/" }