Detail práce

Analýza genomických dat s využitím algoritmu BLAST

Bakalářská práce Student: Křížová Martina Akademický rok: 2007/2008 Vedoucí: Jaša Petr, Ing.
Název anglicky
Analysis of Genomic Data with the Assistance of Algorithm BLAST
Jazyk práce
český
Abstrakt

Tato bakalářská práce se zabývá analýzou genomických dat s využitím algoritmu BLAST. V teoretické části popisuje genetické informace, jejich význam a strukturu. Dále zde naleznete popis algoritmu BLAST, Smith-Waterman a Needleman-Wunsch a s algoritmem BLAST spojenou Karlin-Altschul statistiku. Tato práce také pojednává o typech databází jako prostorové, deduktivní a relační, které ukládají genomické informace. Druhá část se zabývá návrhem a implementací aplikace, která využívá zmíněné algoritmy a databázi Oracle 10g R2. Součástí práce je i testování či srovnání výstupů algoritmů.

Klíčová slova

Genetika, DNA, protein, BLAST, Smith-Waterman, Needleman-Wunsch, substituční matice BLOSUM, PAM, teorie Margaret Dayhoff, Karlin-Altschul statistiky, Oracle 10g

Ústav
Ústav informačních systémů FIT VUT v Brně
Studijní program
Informační technologie
Soubory
Stav
obhájeno, hodnocení B
Obhajoba
26. srpna 2008
Oponent
Rudolfová Ivana, Ing., Ph.D.
Komise
Švéda Miroslav, prof. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT), předseda
Křena Bohuslav, Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Lukáš Roman, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT), člen
Motyčka Arnošt, doc. Ing., CSc. (Mendelu), člen
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT), člen
Zbořil František, doc. Ing., Ph.D. (UITS FIT VUT), člen
Citace
KŘÍŽOVÁ, Martina. Analýza genomických dat s využitím algoritmu BLAST. Brno, 2008. Bakalářská práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2008-08-26. Vedoucí práce Jaša Petr. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/thesis/6644/
BibTeX 
@bachelorsthesis{FITBT6644,
    author = "Martina K\v{r}\'{i}\v{z}ov\'{a}",
    type = "Bakal\'{a}\v{r}sk\'{a} pr\'{a}ce",
    title = "Anal\'{y}za genomick\'{y}ch dat s vyu\v{z}it\'{i}m algoritmu BLAST",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2008,
    location = "Brno, CZ",
    language = "czech",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/thesis/6644/"
}

Závěrečné práce

Nahoru