Detail výsledku

FireProt-ASR

Vznik: 2019
Typ
software
Jazyk
anglicky
Autoři
Musil Miloš, Ing., Ph.D., UIFS (FIT)
Khan Rayyan
Beier Andy, Dr.
Štourač Jan, FIT (FIT)
Konegger Hannes
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr., UMEL (FEKT)
Bednář David, FIT (FIT)
Popis

FireProt-ASR is a web server for an automated calculation of ancestral sequences. Fireprot-ASR allows users to perform ancestral sequence reconstruction starting from a single protein sequence. The pipeline first compiles a dataset of catalytically similar protein sequences, reduces the starting dataset to the required size, aligns them, construct their phylogenetic tree, and then reconstruct ancestral nodes together with the correction of the ancestral gaps. It also allows user to input their own data and start from a different point in the pipeline.

Klíčová slova

protein engineering, thermostable proteins, ancestral sequence reconstruction, evolutionary design, protein stability

Umístění

Nástroj je dostupný na internetové adrese: http://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprotasr

Licence
Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licenční poplatek
Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek
Projekty
Nástroje, metody a technologie ICT pro podporu konceptu smart cities, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-17-3964, zahájení: 2017-03-01, ukončení: 2020-02-29, ukončen
Výzkumné skupiny
Pracoviště
Nahoru