Detail publikace
Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)
Struktura proteinů, databáze struktur proteinů, shlukování založené na hustotě, sekvenčně-strukturní vztahy v proteinech, shlukování proteinových fragmentů, predikce struktury proteinů, hledání sekvenčně-strukturních fragmentů.
V této knize představujeme novou metodu pro shlukování proteinových substruktur, kterou jsme vyvinuli za účelem studia vztahů mezi sekvencí a strukturou proteinů. Popisujeme zde některé vlastnosti navržené metody a experimentální výsledky získané analýzou reálných dat z databáze PDB (Protein Data Bank). Dále jsou zde uvedeny výsledky srovnání navržené metody s metodami, které se pro shlukování proteinových struktur používají nejčastěji. Hlavními výhodami navržené metody jsou její vysoká efektivita a škálovatelnost. Tyto vlastnosti umožňují provádět rozsáhlé analýzy nad reálnými daty. Na závěr potom představujeme možnost využití navržené metody pro hledání takových sekvenčních profilů, které se v přírodě vyskytují ve více strukturních uspořádáních, ale zároveň je počet těchto uspořádání omezený.
@book{BUT62045,
author="Ivana {Burgetová} and Jaroslav {Zendulka} and Matej {Lexa}",
title="Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis",
year="2010",
publisher="Faculty of Information Technology BUT",
address="Brno",
pages="102",
isbn="978-80-214-4207-8"
}