Detail publikace

Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis

BURGETOVÁ Ivana, ZENDULKA Jaroslav a LEXA Matej. Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis. Brno: Fakulta informačních technologií VUT v Brně, 2010. ISBN 978-80-214-4207-8.
Název česky
Shlukovací techniky pro analýzu proteinových fragmentů
Typ
odborná monografie
Jazyk
angličtina
Autoři
Klíčová slova
Struktura proteinů, databáze struktur proteinů, shlukování založené na hustotě, sekvenčně-strukturní vztahy v proteinech, shlukování proteinových fragmentů, predikce struktury proteinů, hledání sekvenčně-strukturních fragmentů.
Abstrakt
V této knize představujeme novou metodu pro shlukování proteinových substruktur, kterou jsme vyvinuli za účelem studia vztahů mezi sekvencí a strukturou proteinů. Popisujeme zde některé vlastnosti navržené metody a experimentální výsledky získané analýzou reálných dat z databáze PDB (Protein Data Bank). Dále jsou zde uvedeny výsledky srovnání navržené metody s metodami, které se pro shlukování proteinových struktur používají nejčastěji. Hlavními výhodami navržené metody jsou její vysoká efektivita a škálovatelnost. Tyto vlastnosti umožňují provádět rozsáhlé analýzy nad reálnými daty. Na závěr potom představujeme možnost využití navržené metody pro hledání takových sekvenčních profilů, které se v přírodě vyskytují ve více strukturních uspořádáních, ale zároveň je počet těchto uspořádání omezený.
Rok
2010
Strany
102
ISBN
978-80-214-4207-8
Vydavatel
Fakulta informačních technologií VUT v Brně
Místo
Brno, CZ
BibTeX
@BOOK{FITPUB9504,
   author = "Ivana Burgetov\'{a} and Jaroslav Zendulka and Matej Lexa",
   title = "Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis",
   pages = 102,
   year = 2010,
   location = "Brno, CZ",
   publisher = "Faculty of Information Technology BUT",
   ISBN = "978-80-214-4207-8",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/9504"
}
Nahoru