Detail výsledku

Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA

VOGEL, I.; ZEDEK, F.; OČENÁŠEK, P. Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA. In Human Interface and the Management of Information. Interacting with Information. Lecture Notes in Computer Science. Lecture Notes in Computer Science. Berlin Heidelberg: Springer Verlag, 2011. no. 1, p. 165-169. ISBN: 978-3-642-21792-0. ISSN: 0302-9743.
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Vogel Ivan, Ing., Ph.D.
Zedek František
Očenášek Pavel, Mgr. Ing., Ph.D., UIFS (FIT)
Abstrakt

This paper describes a modified algorithm for inferring phylogenetictrees based on distance techniques. The input of the algorithmconsists of predefined clusters of data. It uses a usual agglomerative approach,however it involves a novel technique for distance matrix creationas the task of clustering predefined groups of human mitochondrial DNAsequences should be fulfilled.

Klíčová slova

intra-group analysis, substitution model, position-specific
clustering vector, mtDNA, population divergence, phylogenetic tree,
neighbor joining

Rok
2011
Strany
165–169
Časopis
Lecture Notes in Computer Science, roč. 6771, č. 1, ISSN 0302-9743
Sborník
Human Interface and the Management of Information. Interacting with Information
Řada
Lecture Notes in Computer Science
Konference
HCII 2011
ISBN
978-3-642-21792-0
Vydavatel
Springer Verlag
Místo
Berlin Heidelberg
DOI
10.1007/978-3-642-21793-7_20
EID Scopus
2-s2.0-79960338966
BibTeX 
@inproceedings{BUT76261,
  author="Ivan {Vogel} and František {Zedek} and Pavel {Očenášek}",
  title="Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA",
  booktitle="Human Interface and the Management of Information. Interacting with Information",
  year="2011",
  series="Lecture Notes in Computer Science",
  journal="Lecture Notes in Computer Science",
  volume="6771",
  number="1",
  pages="165--169",
  publisher="Springer Verlag",
  address="Berlin Heidelberg",
  doi="10.1007/978-3-642-21793-7\{_}20",
  isbn="978-3-642-21792-0",
  issn="0302-9743"
}
Projekty
Pokročilé bezpečné, spolehlivé a adaptivní IT, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-11-1, zahájení: 2011-01-01, ukončení: 2013-12-31, ukončen
Pokročilé rozpoznávání a prezentace multimediálních dat, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-11-2, zahájení: 2011-01-01, ukončení: 2013-12-31, ukončen
Výzkum informačních technologií z hlediska bezpečnosti, MŠMT, Institucionální prostředky SR ČR (např. VZ, VC), MSM0021630528, zahájení: 2007-01-01, ukončení: 2013-12-31, řešení
Výzkumné skupiny
NES@FIT - Výzkumná skupina počítačové sítě (VZ NES@FIT)
Pracoviště
Ústav informačních systémů (UIFS)
Nahoru