Detail výsledku

HotSpot Wizard 2.0

Vznik: 2015
Typ
software
Jazyk
anglicky
Autoři
Štourač Jan, FIT (FIT)
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D., FIT (FIT)
Chovancová Eva, Mgr., Ph.D., FIT (FIT)
Musil Miloš, Ing., Ph.D., UIFS (FIT)
Brezovský Jan, FIT (FIT)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr., UMEL (FEKT)
Popis

HotSpot Wizard is a web server for automatic identification of hot spots for engineering of substrate specificity, activity or entantioselectivity of enzymes and for annotation of protein structures. HSW 2.0 integrates 3 databases and 18 computational tools, including our in-house tool for analysis of protein tunnels and channels Caver 3.0. In the output, users can explore hot spots based on 4 protein engineering strategies: (i) functional hot spots represented by highly mutable residues located in the active site pocket or access tunnels, (ii) stability hot spots represented by flexible residues, (iii) stability hot spots identified by back-to-consensus approach, and (iv) correlated hot spots represented by pairs of coevolving residues that modulate enzyme activity and selectivity.

Klíčová slova

protein engineering; smart library design; computational mutagenesis; hotspot prediction

Umístění

Nástroj je dostupný na internetové adrese:http://loschmidt.chemi.muni.cz/hotspotwizard2

Licence
Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licenční poplatek
Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek
Licenční podmínky

Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Michaela Kavková, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 470.

Projekty
Výzkum pokročilých metod ICT a jejich aplikace, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-14-2299, zahájení: 2014-01-01, ukončení: 2016-12-31, ukončen
Výzkumné skupiny
Pracoviště
Nahoru