Detail práce

Single-Cell Genotyping

Disertační práce Student: Vogel Ivan Akademický rok: 2020/2021 Vedoucí: Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc.
Název česky
Single-Cell genotypování
Jazyk práce
anglický
Abstrakt

Single-cell genotypovanie je náročnou oblasťou genomiky kvôli nedostatku DNA a metódy, ktoré DNA amplifikujú, dáta zašumujú. Táto práca mapuje aktuálne trendy v bioinformatickej analýze genomických dát, najmä genotypovanie SNP micročipov a navrhuje a implementuje pôvodnú metódu na odstránenie šumu zo single-cell dát. Ďalej prezentuje niekoľko originálnych algoritmov na získavanie znalostí zo single cell dát a funcionalita celého workflow je demonštrovaná na reálnych dátach - produktoch meiózy u žien.

Klíčová slova

genotypování, hromadné DNA, jediná bunka, strojové učení, diskriminační analýza, rekombinace, SNP mikročip

Ústav
Ústav informačních systémů FIT VUT v Brně
Studijní program
Výpočetní technika a informatika, obor Výpočetní technika a informatika
Soubory
Stav
obhájeno
Obhajoba
12. října 2020
Citace
VOGEL, Ivan. Single-Cell Genotyping. Brno, 2020. Disertační práce. Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií. 2020-10-12. Vedoucí práce Zendulka Jaroslav. Dostupné z: https://www.fit.vut.cz/study/phd-thesis/657/
BibTeX 
@phdthesis{FITPT657,
    author = "Ivan Vogel",
    type = "Diserta\v{c}n\'{i} pr\'{a}ce",
    title = "Single-Cell Genotyping",
    school = "Vysok\'{e} u\v{c}en\'{i} technick\'{e} v Brn\v{e}, Fakulta informa\v{c}n\'{i}ch technologi\'{i}",
    year = 2020,
    location = "Brno, CZ",
    language = "english",
    url = "https://www.fit.vut.cz/study/phd-thesis/657/"
}

Závěrečné práce

Nahoru