Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

Zkratka: MBI

Délka studia: 2 roky

Počet kreditů: 120

Program: Informační technologie

Jazyk výuky: česky

Forma studia: prezenční

Akreditace od: 2005 Akreditace do: 2024 Ukončení přijímání: 2019

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student magisterského studijního programu získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti ve zvoleném oboru, a získá tak potřebný znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování řešených problémů jak v badatelské a vědecké, tak i v inženýrské praxi.

Garant
Profil absolventa oboru

Absolvent magisterského studijního programu je připraven samostatně řešit problémy informačních technologií v inženýrské praxi s využitím soudobých poznatků vědy. V praxi se uplatní jako samostatný tvůrčí pracovník daného oboru informačních technologií, tedy v oborech zaměřených na informační systémy a jejich bezpečnost, inteligentní systémy, počítačové systémy, sítě a komunikace, počítačovou grafiku a multimédia nebo vedoucí týmu pracovníků složených z různých oborů informačních technologií.

Rozsah státních závěrečných zkoušek

Státní závěrečná zkouška (SZZ) má dvě části, a to obhajobu diplomové práce a ústní část v podobě odborné rozpravy o zadaných tématických okruzích z předmětu Bioinformatika a biocomputing, jehož náplň vychází z vybraných povinných předmětů na oboru MBI, kterými jsou Bioinformatika, Biologií inspirované počítače, Teorie her, Pokročilá bioinformatika, Získávání znalostí z databází, Biometrické systémy, Soft Computing, Matematické struktury v informatice, Teoretická informatika, Molekulární genetika, Pokročilé databázové systémy a Paralelní a distribuované algoritmy. Rada studijního oboru schválí výběr tématických okruhů. Studenti jsou o těchto tématických okruzích informování nejméně 2 měsíce před SZZ v daném akademickém roce. Každému studentovi jsou zadány dva tématické okruhy.

Příklady témat závěrečných prací
  • Analýza dat z mikročipů pro zjišťování genové exprese
  • Predikce struktury proteinu
  • Vizualizace molekulárních struktur
  • Hardwarová akcelerace vyhledávání v biologických databázích.
  • Evoluční návrh klasifikátoru biologických dat
  • Akcelerace evolučního návrhu v hardware
  • Symbolická regrese v úloze analýzy biologických dat
  • Modelování chování systému pomocí celulárního automatu.

Diplomové práce jsou uloženy v Knihovně FIT, Božetěchova 2, Brno. Seznam diplomových prací včetně detailů je dostupný na Webu FIT:
https://www.fit.vut.cz/study/theses/.cs

Výběr akademického roku a studijního plánu

1. ročník, zimní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
BC_MOG1Molekulární genetika I3PZkFCH
BIOBiometrické systémy5PZaZkFIT
MATMatematické struktury v informatice *)5PZkFIT
PDBPokročilé databázové systémy5PZaZkFIT
TINTeoretická informatika7PZaZkFIT

1. ročník, letní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
BIFBioinformatika5PZkFIT
BINBiologií inspirované počítače5PZkFIT
PRLParalelní a distribuované algoritmy5PZaZkFIT
PP1Projektová praxe 15VKlzFIT

2. ročník, zimní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
PBIPokročilá bioinformatika4PZkFIT
SEPSemestrální projekt5PKlzFIT
SFCSoft Computing5PZaZkFIT
THETeorie her5PZaZkFIT
ZZNZískávání znalostí z databází5PZaZkFIT
PP2Projektová praxe 25VKlzFIT

2. ročník, letní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
DIPDiplomová práce13PZaFIT

libovolný ročník, zimní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
HSCHardware/Software Codesign5PVCZaZkFIT
PCSPokročilé číslicové systémy5PVCZkFIT
AEUAngličtina pro Evropu3PVHZaZkFIT
FCEAngličtina: praktický kurz obchodní konverzace a prezentace3PVHZaFIT
FIKFilozofie a kultura *)3PVHZaFIT
FITDějiny a filozofie techniky3PVHZaFIT
HKOManažerská komunikace a prezentace3PVHZaFIT
HVRManažerské vedení lidí a řízení času3PVHZaFIT
JA3Anglická konverzace na aktuální témata3PVHZaZkFIT
PRMPrávní minimum3PVHZaFIT
RETRétorika3PVHZaFIT
AGSAgentní a multiagentní systémy5PVIZkFIT
SINInteligentní systémy5PVIZkFIT
BISBezpečnost informačních systémů5PVOZaZkFIT
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)5PVSZkFIT
AISAnalýza a návrh informačních systémů5VZaZkFIT
AVSArchitektury výpočetních systémů5VZaZkFIT
BMSBezdrátové a mobilní sítě5VZaZkFIT
EIPEkonomie informačních produktů5VZkFIT
GALGrafové algoritmy5VZkFIT
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javě5VZaZkFIT
GMUGrafické a multimediální procesory5VZaZkFIT
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Window5VZkFIT
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normy5VZkFIT
PDIProstředí distribuovaných aplikací5VZkFIT
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)5VZkFIT
PGRPočítačová grafika5VZkFIT
PKSaPokročilé komunikační systémy (v angličtině)5VZaZkFIT
POVaPočítačové vidění (v angličtině)5VZkFIT
ROBaRobotika (v angličtině)5VZkFIT
SAVStatická analýza a verifikace5VZaZkFIT
SEMSenzory a měření5VZaZkFIT
SRIStrategické řízení informačních systémů5VZkFIT
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)5VKlzFIT
VINVýtvarná informatika5VKlzFIT
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)5VZkFIT
ZPXZahraniční odborná praxe5VZaFIT

libovolný ročník, letní semestr

ZkrNázevKrPovZakFa
NAVNávrh vestavěných systémů5PVCZkFIT
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokoly5PVCZkFIT
PPPPraktické paralelní programování5PVCZaZkFIT
AEUAngličtina pro Evropu3PVHZaZkFIT
FIKFilozofie a kultura3PVHZaFIT
FITDějiny a filozofie techniky *)3PVHZaFIT
HKOManažerská komunikace a prezentace3PVHZaFIT
HVRManažerské vedení lidí a řízení času3PVHZaFIT
JA3Anglická konverzace na aktuální témata3PVHZaZkFIT
PRMPrávní minimum3PVHZaFIT
RETRétorika3PVHZaFIT
EVOAplikované evoluční algoritmy5PVIZkFIT
SNTSimulační nástroje a techniky5PVIZaZkFIT
KRYKryptografie5PVOZaZkFIT
NSBNávrh, správa a bezpečnost5PVOZaZkFIT
POSPokročilé operační systémy5PVOZkFIT
KKOKódování a komprese dat5PVSZaZkFIT
ZREZpracování řečových signálů5PVSZkFIT
BZABezpečná zařízení5VZkFIT
CSOaCCNA Kybernetická bezpečnost (v angličtině)5VKlzFIT
DFAaDigitální forenzní analýza (v angličtině)5VZkFIT
DJADynamické jazyky *)5VZkFIT
FLPFunkcionální a logické programování5VZaZkFIT
FVSFunkční verifikace číslicových systémů5VZkFIT
FYOFyzikální optika5VZkFIT
GISGeografické informační systémy *)5VZaZkFIT
LOGLogika5VZaZkFIT
MBAAnalýza systémů založená na modelech5VZkFIT
MPA-SYSSystems Biology5VZaZkFEKT
MPC-MATMaticový a tenzorový počet5VZaZkFEKT
MPRManagement projektů5VZaZkFIT
MULMultimédia5VZkFIT
OPMOptimalizace4VZaZkFIT
PISPokročilé informační systémy5VZaZkFIT
PMAProjektový manažer5VKlzFIT
RTSaSystémy pracující v reálném čase (v angličtině)5VZkFIT
SLOaSložitost (v angličtině)5VZkFIT
SPPSystémy odolné proti poruchám5VZaZkFIT
SSPStochastické procesy4VZaZkFSI
UXIaUživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině)5VKlzFIT
VGEVýpočetní geometrie5VZkFIT
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)5VKlzFIT
VNVVysoce náročné výpočty5VZkFIT
VYFVýpočetní fotografie *)5VKlzFIT
WAPInternetové aplikace5VZaZkFIT
ZPOZpracování obrazu5VZkFIT
ZPXZahraniční odborná praxe5VZaFIT
Předmět není v tomto akademickém roce otevřen
Zak: Způsob zakončení předmětu: Zk - zkouška, Za - zápočet, Klz - klas. zápočet, Kol - Kolokvium
Pov: P - povinný, PV - povinně volitelný, D - doporučený, V - volitelný

Skupiny povinně volitelných předmětů

ZkrMin. předmětůMax. předmětůMin.kredPřes jakoPředmětyNázev
C190VHSC, NAV, PCS, PDS, PPPHardware a sítě
H113VAEU, FCE, FIK, FIT, HKO, HVR, JA3, PRM, RETHumanitní předmět
I190VAGS, EVO, SIN, SNTModerní umělá inteligence
O190VBIS, KRY, NSB, POSOperační systémy a bezpečnost
S190VKKO, ZPJa, ZREZpracování dat a signálů
Pokud je povoleno zapsat si více předmětů skupiny PV než je požadované minimum, pak úspěšně absolvované předměty, které překročí Min. předmětů (resp. Min.kred, pokud není 0) skupiny PV, budou studentovi zařazeny jako předměty povinnosti Přes jako.
Nahoru